Las islas Corazón y Fragatas se localizan cerca de la desembocadura del río Chone, frente a las ciudades de Bahía de Caráquez y San Vicente. El refugio protege los últimos remanentes de manglar que quedan en este estuario. El área es sitio de descanso y reproducción de aves marinas y playeras, entre las que destaca una importante colonia de fragatas. Por su cercanía y fácil acceso, se ha convertido en un sitio preferido para la realización de actividades recreativas. Los recorridos por sus canales y caminatas entre el manglar, permitirán comprender por qué es considerada como un refugio para muchas especies.
Desde Guayaquil. Se toma la vía a Daule hasta Nobol (41 km) y luego a Montecristi (144 km). Se continúa por la troncal del Pacífico hacia San Vicente (87 km). Al cruzar el puente Bahía – San Vicente, en el primer redondel se gira a la derecha para tomar la vía San Antonio – Chone hasta la comunidad de Puerto Portovelo (10 – 15 minutos). Aquí se encuentran la caseta de control y el centro de interpretación del refugio.
También se puede llegar por vía fluvial desde Bahía de Caráquez o San Vicente, desde donde se renta una panga para llegar a Puerto Portovelo.
Desde Quito por varias rutas de acceso: Quito – El Carmen – Pedernales – San Vicente – Comunidad Puerto Portovelo. Quito – El Carmen – Chone – Comunidad Puerto Portovelo.
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